Genomepedia

Персональная геномная энциклопедия Кирилла Холоденко - 631 455 SNP, разобранных человеческим языком. Не справочник мутаций, а история о том, как устроен конкретный человек: от нейрохимии мозга до древних миграций 30 000 лет назад.

Для мамы
Вся генетика Кирилла на одной странице - без единого научного термина. Что важно знать, какие лекарства нельзя, почему он такой, какой есть.

О проекте

В декабре 2019 года я сдал тест 23andMe v5 и получил файл с 631 455 однонуклеотидными полиморфизмами (SNP). С тех пор я изучаю этот файл - ген за геном, вариант за вариантом - и перевожу сухие биоинформатические данные в понятные истории о том, как устроено моё тело и мозг.

Genomepedia - это ongoing-проект. Здесь уже 58 статей, и с каждым месяцем их становится больше. 8 тематических глав покрывают основные области - от нейробиологии до происхождения, а отдельные статьи по генам погружаются в молекулярные детали.

Контент носит образовательный характер. Все выводы подкреплены ссылками на PubMed, но это не медицинская рекомендация.

Genomepedia - персональная геномная энциклопедия
631 455 SNP, разобранных человеческим языком
Об авторе
Кирилл Холоденко

Кирилл Холоденко - разработчик, вайбкодер, digital creator, предприниматель. Жил 5 лет в Шанхае, закончил 上海外国语大学 (Shanghai International Studies University), получив степень магистра международных отношений. С 2023 года ушёл с головой в AI-assisted кодинг: создаю сайты, Telegram мини-приложения, ботов, micro-SaaS, моушн-анимации, афиши и многое другое. Этот проект - попытка разобраться в собственной генетике на уровне, который обычно доступен только исследователям.

Платформа23andMe v5
СборкаGRCh37 / hg19
SNP631 455
Y-гаплогруппаR1b-L23
мтДНКU5b
APOEε3/ε3
Дата тестаДекабрь 2019

Что я уже узнал о себе по ДНК

20 ключевых находок. Каждая - конкретный факт с реальными последствиями.

AuDHD
Мой мозг - одновременно СДВГ и аутизм. Семь генов сходятся в единый нейротип: гиперфокус на интересном, провал внимания на рутинном, гиперэмпатия вместо «холодности». Это не два диагноза, а один.
COMT AG
Мозг-переключатель: под дедлайном включается режим «воина» (быстрый клиренс дофамина), в покое - режим «мыслителя». Только 45% европейцев имеют такую гибкость.
ADH1B + ALDH2
Идеальная ловушка: медленный ADH1B даёт длинную приятную фазу опьянения, а быстрый ALDH2 убирает похмелье. Выглядит как суперсила, но на самом деле - генетический путь к зависимости.
ACTN3 R/R
Генотип элитных спринтеров: полностью функциональный α-актинин-3. Среди олимпийских спринтеров таких 97%. Пиковая мышечная мощность на 8-12% выше, чем у людей без этого белка.
SCN9A GG
Повышенный болевой порог - натриевые каналы ноцицепторов менее чувствительны. На практике это значит, что я могу не заметить травму, пока не увижу её глазами.
CYP1A2 AA
Ультрабыстрый метаболизм кофеина. Мой организм расщепляет кофеин в 4 раза быстрее обычного - за 2-3 часа вместо 5. Можно пить кофе и без кардиориска, но нужно больше для эффекта.

Читать по порядку

Энциклопедия задумана как книга. Каждая глава - самостоятельная история, но вместе они складываются в полную картину одного генома. В конце каждой главы - кнопка на следующую.

1
Нейробиология сверхновой: AuDHD
СДВГ + аутизм как единый нейротип. Гиперфокус, гиперэмпатия, утечка норадреналина.
2
Эмоциональные американские горки
Кальциевые каналы, серотониновый дабл-хит и дисфория отвержения.
3
Идеальная ловушка для печени
Максимум удовольствия от алкоголя, минимум похмелья, но печень под ударом.
4
Неубиваемая машина с уязвимостями
Броня от Альцгеймера, но варфарин и статины могут убить.
5
Киборг без чувства боли
Чистая выносливость, отключённые ноцицепторы, турбо-метаболизм кофеина.
6
Переключатель бессмертия
FOXO3 + CETP - два аллеля долгожителей. Как включить генетику столетних.
7
Призраки ледникового периода
Ямная культура, охотники палеолита U5, неандертальское наследие.
8
Биологические часы
Ген CLOCK, генетическая сова, и почему сон - главный стабилизатор.
Разделы энциклопедии
Все статьи по генам (48)

Детальные разборы отдельных генов и полиморфизмов. Каждая статья - один ген, один вариант.

Хронология публикаций
20 мар.
14:00 MSK
Фамилия Холоденко: генеалогический поиск
Документированная история рода Холоденко: Черниговщина, Харьковщина, Вятка. Военные архивы, Арользенские документы, семейное предание об остарбайтере Василии, Y-ДНК R1a-YP4172 и ДНК-совпадения с родственниками.
11 мар.
20:38 MSK
PNPLA3 - печёночный кладовщик, который у меня иногда ленитсяCG
PNPLA3 rs738409 CG у Кирилла - это не запрет на алкоголь, а предупреждение: печень складирует жир охотнее, а расплачивается позже
11 мар.
20:35 MSK
HTR1A - серотониновый ручник, который у меня отпущенCC
HTR1A rs6295 CC у Кирилла похож на серотониновый ручник, который срабатывает слабее: эмоции разгоняются легче, а часть SSRI-эффекта зависит от контекста и соседних генов
11 мар.
14:34 MSK
DRD1 — педаль газа для мозгаGG
Дофаминовый рецептор, который разгоняет работу нейронов и критичен для рабочей памяти.
11 мар.
02:00 MSK
CHRNA5 — Никотиновые рецепторы и ацетилхолинGG
Стандартная чувствительность к никотину и нормальная функция ацетилхолиновых рецепторов.
Критические фармалерты

Важные находки, что я записал и покажу при случае врачу.

Factor V Leiden CT - наследственная тромбофилия. Риск тромбоза x3-8. Сообщить хирургу! Подробнее →
VKORC1 TT - высокая чувствительность к варфарину. Нужна 25-30% стандартной дозы. Подробнее →
SLCO1B1 CT - никогда не принимать симвастатин. Высокий риск миопатии. Подробнее →
LCT GG - генетическая непереносимость лактозы. Подробнее →
Статус проекта

Genomepedia - живой проект. Новые статьи и обновления добавляются по мере анализа данных.

Статей58
Тематических глав8
Статей по генам48
Источник данных23andMe v5 Chip
Геном секвенированДекабрь 2019
Последнее обновлениеМарт 2026 г.

Планируется: полногеномное секвенирование (WGS), эпигенетический анализ, подключение SQL-базы для глубокого парсинга SNP по научным базам данных (ClinVar, PharmGKB, GWAS Catalog).